L'experiència d'Elionor a bord del vaixell escola Juan Sebastián Elcano ha resultat ser un desafiament intens i exigent. Durant les primeres setmanes, la princesa va haver d'enfrontar un dur procés d'adaptació, ja que, a diferència dels seus companys, no tenia experiència prèvia en navegació ni estava acostumada a la vida en un vaixell de tals dimensions i característiques. A això se sumava la falta de comoditats, la qual cosa va fer que la seva aclimatació fos encara més complicada.
Els seus companys guàrdies marines portaven ja tres anys de formació i estaven més preparats per afrontar els rigors de la travessia, mentre que Elionor va haver de bregar amb marejos i vòmits propis dels inexperts. En diverses ocasions, es va veure obligada a absentar-se d'algunes classes a causa del seu malestar, per la qual cosa l'equip mèdic del vaixell li va receptar biodramina per ajudar-la a suportar els símptomes.

A més del repte físic, la jove també va enfrontar un desafiament mental, ja que va passar 22 dies sense tocar terra ferma, el període més llarg que ha passat en alta mar fins ara. Aquest extens trajecte, que connectava Espanya amb el Brasil, finalment va concloure el 14 de febrer, quan el vaixell va atracar al port de Sant Salvador de Bahia. Els joves marins van aprofitar l'escala per descansar i gaudir d'uns dies de lleure, coincidint amb l'avantsala del carnaval.
Malgrat que les càmeres esperaven l'arribada d'Elionor al port, la princesa va aconseguir mantenir-se tranquil·la i gaudir del breu descans. Tanmateix, un fotògraf, que ni tan sols sabia de la seva presència, la va captar en una festa juntament amb un dels seus companys de l'escola naval. El jove, de 20 anys, madrileny, pertanyent a una família benestant i amb una destacada trajectòria acadèmica, ha estat assenyalat com un possible interès sentimental de l'hereva.
Segons el testimoni del fotògraf, ambdós es mostraven molt propers i van arribar a besar-se. En aquell moment, els escortes de la princesa van detectar la situació i, de manera poc amigable, el van expulsar del lloc. Es diu que aquest mateix jove ja havia estat vist amb Elionor en un pub de Pontevedra a l'octubre, la qual cosa indicaria que la seva relació no és recent, sinó que data des de finals d'agost, quan la princesa va ingressar en l'Escola Naval de Marín. Pel que sembla, va ser ell que es va apropar primer, generant-se entre ambdós una notable connexió.
Elionor ha descobert les veritables intencions del seu company
L'aparició d'aquestes imatges ha generat un gran malestar en Elionor. La jove sent que no pot tenir un moment d'intimitat ni si més no en aquest viatge, que forma part de la seva formació militar. Encara que és conscient de l'interès que desperten els seus moviments com a futura reina d'Espanya, l'incomoda que es generin especulacions sobre la seva vida personal.
A més, aquest episodi podria haver tensat encara més la seva relació amb el jove en qüestió. Se sospita que ell podria haver filtrat la imatge, la qual cosa ha incrementat la desconfiança d'Elionor. En resposta a aquesta situació, els seus pares, el rei Felip VI i la reina Letícia, li han advertit que ha de ser especialment acurada durant la seva pròxima estada a l'Uruguai, un destí en el qual la discreció serà clau. De fet, el rei té previst viatjar fins allà per desviar l'atenció mediàtica.
Molesta i sobrepassada per la repercussió de l'assumpte, Elionor ha manifestat el seu descontentament, especialment cap al seu company, a qui ara veu com una persona oportunista. No ha donat senyals que entre ells existeixi una relació sentimental i lamenta que la imatge pública que projecta es vegi afectada per rumors infundats.
