La vida de Felip VI roman amb pany i clau. Casa Reial protegeix el rei. Mai no s'ha sabut res de la seva vida privada. Sempre es la presentat com un home fidel a la seva dona, a diferència de Joan Carles I amb la reina Sofia, per tots és sabut que l'emèrit enganyava la mare dels seus fills amb milers de dones, aquesta era una de les seves perdicions més grans.
Des que va saltar la notícia de la suposada infidelitat de Letizia a Felip VI amb Jaime del Burgo, el matrimoni s'ha mostrat més distant, i el rei ha fet els seus plans per separat de la reina. Molts caps de setmana se n'ha anat amb els seus amics de la infantesa o algun familiar, però mai no se li ha vist en companyia de cap altra dona que no sigui Letizia, almenys en actitud còmplice.
Juan Carlos les seves relacions extramatrimonials li han esquitxat amb presumptes fills il·legítims, encara que ell mai no ha confirmat públicament a cap d'ells, però amb algun guarda una semblança física més que raonable. Felip VI, de jove, era molt seductor, i encara que era més seriós en les seves relacions, també es va parlar d'un suposat embaràs amb una de les seves parelles.
Isabel Sartorius es va quedar embarassada de Felip VI
Isabel Sartorius va ser la primera parella oficial del llavors príncep Felip VI. El seu romanç va sortir a la llum a l'estiu de 1989, quan van ser fotografiats a Palma de Mallorca en actituds afectuoses. La relació no comptava amb el beneplàcit dels reis Joan Carles i Sofia, ja que els pares d'Isabel estaven separats i la seva mare enfrontava problemes d'addicció a les drogues. De fet, Sartorius va esmentar en la seva autobiografia que quan era adolescent, amb només 14 anys, es veia obligada a comprar droga per a la seva mare.
La trobada entre Felipe i Isabel va passar a la discoteca Joy Eslava, on es van conèixer i van sentir una atracció mútua immediata. Ell tenia 21 anys i a ella 24. A partir d'aquella nit, van començar a veure's amb freqüència i van mantenir una relació sentimental durant dos anys, des de 1989 fins a 1991.
La relació va acabar, en part, a causa de la mala reputació que la família d'Isabel i ella mateixa tenien en els mitjans de comunicació. Tanmateix, la història va fer un gir inesperat quan la mare d'Isabel, Nora de Liechtenstein, va trucar a la reina Sofia per informar-lo que la seva filla estava embarassada. Segons la conversa relatada, la reina Sofia va respondre fredament: "Perdona, vosaltres teniu un problema, nosaltres no", el que va marcar el final definitiu de la relació.
Després d'aquesta ruptura, es va saber que Isabel Sartorius mantenia una altra relació en secret, amb Javier Fitz-James Stuart de Soto. Temps després, Isabel va afirmar que la seva filla, Mencía, era filla de Javier. Es va anunciar un compromís matrimonial entre ambdós, però el casament va ser cancel·lat tot just dues setmanes abans de la seva celebració.
Amb el pas del temps, van sorgir rumors que Mencía podria ser filla del príncep Felip, ja que, segons alguns, s'assemblava molt a ell. No obstant això, quan Mencía va assolir la majoria d'edat i es van fer públiques les seves fotos, va quedar clar que la seva semblança era amb Javier Soto, la qual cosa va dissipar les especulacions sobre la paternitat de Felipe.