La relació entre la infanta Elena i Jaime de Marichalar sempre ha estat envoltada de rumors, i, segons múltiples fonts, no va ser precisament una història d'amor des de l'inici. Igual com els reis emèrits Joan Carles i Sofia, el matrimoni de la infanta i el duc de Lugo mai no va estar marcat per una gran passió. Elena i Marichalar discutien des dels primers dies, fins i tot durant el dia del seu casament. Les tensions eren constants, i ni tan sols l'arribada dels seus fills, Froilán i Victoria Federica, no va aconseguir millorar la situació.
Expliquen algunes cròniques que, des del principi, la infanta Elena desitjava divorciar-se. Segons s'ha explicat, va arribar a comunicar-li al seu pare, el llavors rei Joan Carles I, el seu desig de separar-se. Tanmateix, el rei li va aconsellar que "aguantés" igual com ell ho va fer amb la reina Sofia. Elena va intentar mantenir la relació, però la seva paciència tenia un límit. Just quan va decidir que havia arribat el moment d'anunciar la separació, Marichalar va patir un ictus, la qual cosa va fer que ella hagués de retardar la seva decisió fins que ell es recuperés. Finalment, després d'aquest episodi, va arribar el famós anunci del "cessament temporal de la convivència" el 2007, un eufemisme que va marcar el final del seu matrimoni.
Jaime de Marichalar i la infanta Elena no connectaven al llit conjugal
Des d'aleshores, la relació entre Elena i Marichalar ha estat purament cordial. En públic a penes no se'ls ha vist intercanviar gestos afectuosos, i en algunes ocasions s'han saludat amb un parell de petons, però res més. Malgrat haver compartit una vida i tenir dos fills en comú, la distància emocional sempre va ser evident.
Un dels punts clau que va marcar la seva separació va ser la diferència en els seus gustos i personalitats. I les discrepàncies més grans tenien lloc en la seva intimitat. Marichalar tenia un enfocament molt més experimental en les relacions de parella, mentre que Elena era més tradicional i conservadora. A Marichalar li agradava explorar noves experiències, mentre que la infanta no se sentia còmoda amb aquesta dinàmica. Segons diverses fonts, Elena no tenia un gran interès en l'íntim i preferia un enfocament molt més convencional. Fins i tot s'ha especulat que la infanta podria haver viscut sense una vida sexual activa, ja que per a ella no era una prioritat.
La biògrafa Nuria Tiburcio, en la seva biografia no autoritzada de la infanta, afirmava que Elena va veure a Marichalar una persona divertida i carismàtica, però mai no es va enamorar físicament d'ell. "La seva no va ser mai una relació passional", comentava Tiburcio, subratllant que la falta de sintonia al terreny íntim va ser un dels factors que va contribuir al fracàs del seu matrimoni.