Elionor ha tingut poca relació amb els seus avis paterns per culpa de Letícia. La reina mai no va tenir una bona relació amb els Borbó, així que quan fos el seu moment intentaria venjar-se d'ells, i així va succeir. Els va retirar de la corona eliminant-los les seves funcions institucionals i suprimint-los el sou que percebien per part dels Pressupostos Generals de l'Estat. Amb Joan Carles va ser molt més venjativa. El va obligar a abdicar, i uns anys més tard el va exiliar fins als Emirats Àrabs. Ella ordenava i Felip executava les seves ordres.
La princesa i la seva germana Sofia van créixer acompanyades dels seus avis materns, especialment de Paloma Rocasolano, qui arribava tots els matins a Zarzuela quan eren molt petites per quedar-se a càrrec seu mentre els seus pares treballaven. A la reina Sofia no la deixaven ni apropar-se.
Des que Joan Carles es va exiliar als Emirats Àrabs, Letícia ha intentat que no aparegui cap fotografia de la jove princesa amb l'emèrit. Ni tan sols les poques vegades que s'han reunit, com en el seu divuit aniversari el passat 31 d'octubre. El va veure en el mateix sopar, ja que la reina tampoc no el va deixar assistir a la jura de la Constitució. Tanmateix, Felip es va quedar sorprès davant de les paraules de la princesa tot just veure el seu avi. "A les seves ordres, Majestat," li va dir quadrant-se davant d'ell. Va respectar la jerarquia.
Elionor va mostrar l'amor que sent cap al seu avi Joan Carles
Va tractar amb tots els honors i respectes a l'anterior monarca, sense oblidar que és el seu avi. No obstant això, això va succeir en privat, públicament en cap moment no li ha dedicat unes paraules, ni tan sols li esmenta, com el seu no existís.
Després d'aquesta trobada, no se n'han vist més fins aquest últim cap de setmana. Elionor ja ha començat les classes a Saragossa, però el cap de setmana del 6 i 7 abril va estar a Madrid per acomiadar-se de la seva germana Sofia que volava de nou a Gal·les i de la seva família. Diumenge, per petició de Joan Carles, es va fer un dinar en Zarzuela i es va retrobar amb les seves netes. Elionor es va mostrar molt il·lusionada per tornar a veure el seu avi quatre mesos després. Una vegada més, encara que fos un acte privat i familiar, va seguir el protocol i va respectar la jerarquia. La princesa es va quadrar i li va repetir un "A les seves ordres, Majestat", també va fer la reverència a la reina Sofia, com sempre.