Elionor va iniciar l'aventura més gran de la seva formació militar. Com a part del programa de l'Escola Naval de Marín, els seus guàrdies marines s'embarquen durant sis mesos al conegut vaixell escola Juan Sebastián Elcano. Pel vaixell també va passar Joan Carles I i Felip VI, aquest últim va argumentar que va ser l'aventura més dura, però la més gratificant. La princesa recorrerà un total de vuit països i cada vegada que posi un peu a terra serà tractada com a altesa, ja que es comptarà com una visita d'Estat. No obstant això, en les seves tasques dins de l'Escola Naval serà tractada com la resta dels seus companys.
La princesa ha passat la primera setmana a bord del vaixell escola en alta mar, mentre arribava de Cadis a Tenerife van passar cinc dies. La germana de Sofia va patir el que es coneix com a dolent de terra. Va tenir marejos i nàusees, la jove es va absentar de classe el primer dia pels constants marejos que no li permetien seguir amb normalitat, va estar confinada a la seva cabina.
Felip VI i Letícia creien que podien estar tranquils amb Elionor a bord d'un vaixell escola de màxima seguretat. Cap paparazzi no podria perseguir-la i seria molt complicat saber que fa en el seu dia a dia. Segons ha pogut saber ESdiario, diverses persones segueixen el Juan Sebastián Elcano des que va sortir de Cadis. Realitzaran la mateixa ruta, amb les mateixes escales i les mateixes parades.
Diverses persones de l'alta societat madrilenya fan la mateixa ruta que el vaixell
Les fonts consultades asseguren a ESdiario que la misteriosa embarcació pertany a un conegut empresari madrileny i que a bord de la mateixa viatgen un grup d'amics, a prop de la desena, que tots pertanyen a l'alta societat madrilenya.
Els serveis de seguretat de Casa Reial han estat alertats de la presència d'aquest vaixell i les seves intencions perquè en aquesta ocasió el vaixell escola no compta amb alumnes anònims sinó amb l'Elionor en persona. Consideren que no és una amenaça però que podria alterar el dia a dia a bord.
La distància entre un i un altre és prudencial, però l'Armada vol evitar tant sí com no que es fotografiï Elionor i la resta d'alumnes, ja que han de garantir la seva privacitat i intimitat. Respecte al vaixell en qüestió del grup d'amics que faran la travessia paral·lela a la de l'Elcano, "l'Armada no ha tingut cap mena de reacció més enllà de recordar al patró dels protocols de seguretat i distància que han de mantenir amb el Vaixell Escola espanyol", tal com asseguren a ESdiario les fonts consultades.