Els agents de la policia van entrar en vuit edificis de la Generalitat i van detenir persones clau en l'organització del referèndum. En total, hi va haver 14 alts càrrecs del Govern detinguts. Aquests són tots els investigats per malversació de fons, revelació de secrets i desobediència pel jutge d'instrucció número 13 de Barcelona, Juan Antonio Ramírez Sunyer:
- Josep Maria Jové, ex-secretari general d'Economia i actual diputat d'ERC
- Carles Viver i Pi-Sunyer, jurista i director de l'Institut d'Estudis de l'Autogovern
- Joan Manel Gómez, coordinador al Cesicat
- Jordi Cabrafiga, excap del gabinet de Governació i actual dirigent de JxCat
- Andreu Palacín, cap d'àrea TIC de l'Agència Tributària Catalana
- Antoni Molons, exsecretari de Comunicació del Govern
- Josep Lluís Salvadó, exsecretari d'Hisenda, ara diputat d'ERC
- Francesc Sutrias, director de Patrimoni i Hisenda
- Natàlia Garriga, directora de Serveis d'Economia
- Lluís Domingo Anaya, adscrit a Governació
- Sergio Bellido, conseller delegat a Novoprint SA
- Joaquim Nin Borreda, secretari general de Presidència
- Xavier Puig, àrea TIC del Departament d'Exteriors
- Josuè Sallent, director d'estratègia del Centre de Telecomunicacions i Tecnologies de la Informació (CTTI)
- Pau Furriol, advocat, té una nau a Bigues i Riells, on es van trobar paperetes
- Valentín Arroyo, director corporatiu del CTTI
- Amadeu Alfataj, responsable de la Generalitat a la UE
- Jaume Clotet, director general de Comunicació del Govern
- Joan Ignasi Sànchez, assessor del Departament de Governació
- David Franco, àrea TIC adscrit al Departament de Treball
- Josep Masoliver, responsable de l'àrea d'informàtica de la Fundació PuntCAT
- Juan Martín Angulo, director gerent del CTTI
- Aleix Villatoro, secretari general d'Afers Exteriors
- Núria Llorach, presidenta de la CCMA
- Santiago Vidal, exsenador d'ERC i jutge
- Rosa Maria Rodríguez, directora general de T-Systems Ibérica
- Josep Ginesta, secretari general del Departament de Treball
- Eduard Vila, director de l'Agència Tributària Catalana
- Pau Raventós, exdirector general d'Unipost
- Pere Aragonès, vicepresident del Govern
- Mercedes Martínez, responsable de projectes organitzatius de Vicepresidència
- Màrius Gómez, treballador de T-Systems
- Felipe Andanuche, resposanble de projectes organitzatius de Vicepresidència
- Daniel Gimeno, cap del gabinet tècnic d'Economia
- José María Reig, treballador del CTTI
- Sergi Aymerich, administrador de Global Solutions
- Albert Royo, exsecretari general del Diplocat
- Montserrat Vidal, excap de l'àrea de processos electorals
- José Oriol González, gerent de Buzoneo Directo SL
- Ricard Martí, Marc Martí Publicitat
- Daniel Gimeno, cap del gabinet tècnic de Vicepresidència, Economia i Hisenda
- Rosa Vidal, interventora general de la Generalitat
- Antonio Jesús Vargas, treballador del CTTI
- David Palanques, informàtic del Departament de Treball
- José Oriol González, administrador de Buzoneo Directo SL
- Enric Ocaña, membre de processos electorals
- Marta Garsaball, directora de Serveis del Departament d'Exteriors
- Francesc Udina, director d'Idescat