El 4 de mayo, el Parlamento Europeo acogió un debate sobre el uso de software espías como Pegasus, encontrados a las víctimas del CatalanGate donde las formaciones políticas españolas se encontraron contra las cuerdas. Sin embargo, algunas han insistido en cuestionar el espionaje a independentistas y la veracidad de la investigación de Ctizen Lab. Es el caso de los representantes de Ciudadanos en el Parlamento Europeo. Con Jordi Cañas al frente, los eurodiputados enviaron una serie de preguntas al grupo de investigadores de la Universidad de Toronto poniendo en duda la fiabilidad de su trabajo. Citizen Lab no sólo ha respondido las preguntas de Ciudadanos desmontando sus cuestionamientos, sino que su director, Ronald Deibert, ha compartido las respuestas a través de las redes sociales. Es por eso que el abogado Gonzalo Boye ha asegurado con sarcasmo que Jordi Cañas "no pierde la oportunidad para hacer el ridículo".
Deibert ha compartido la respuesta del equipo de investigación que lidera a través de un tuit en que expone: "Nuestro informe del CatalanGate ha provocado una gran controversia en España". Por este motivo, el director añade que comparte las respuestas que han elaborado con el fin de "ayudar a aclarar nuestra misión". En el mismo tuit, Deibert comparte el documento de casi 20 páginas en que se pueden consultar todas las preguntas y respuestas que la entidad ha respondido meticulosamente a Ciutadans.
Las preguntas formuladas a Citizen Lab cuestionan desde los métodos de investigación hasta el seguimiento del código ético de la Universidad de Toronto. Por ejemplo, Ciutadans pregunta al grupo de investigación si "ha recibido dinero durante su investigación". Citzen Lab lo niega categóricamente, de la misma manera que lo hace con la pregunta: ¿"Hubo algún partido político catalán (como Junts per Catalunya, ERC o CUP) u organizaciones secesionistas? como, Assemblea Nacional Catalana (ANC), Òmnium, involucrados en el proceso de muestreo o la redacción del informe"?.
Uno de los aspectos que más se cuestionan a lo largo del documento, es el papel de Elies Campo en la investigación. Salvo ha participado en la investigación del de Citizen Lab, pero también es una de las víctimas de espionaje con Pegasus. Desde que se destapó el escándalo, la figura y el trabajo de Campo se ha puesto en cuestión y las preguntas de Ciutadans no han sido una excepción. Ronald Deibert ha defendido anteriormente la tarea de Campo y en la respuesta a Cs, Citzen Lab defiende su trabajo.